Wissenschaftler haben gerade die Entdeckung eines neuen, unglaublichen angekündigt Ein weit verbreitetes Virus, das im Menschen lebt Darmbakterien. Er bekam den Namen “crAssphage” und um fast sechs mal häufiger als alle anderen bakteriellen Viren zusammenstellen. Aber wie haben wir es geschafft, ihn nicht so sehr zu bemerken? Zeit?
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Der Grund, warum wir crAssphage noch nicht gefunden haben, ist, dass dass wir nicht wussten, dass wir ihn suchen mussten. Das ist es bedeutet.
Während neue Sequenzierungstechnologien immer mehr werden schnell und billig haben sie noch eine Schwäche: sie Gut, um Dinge zu entdecken, von denen wir bereits wissen, dass sie existieren aber sie sind schlecht geeignet für die Suche nach neuen Organismen. Wann Forscher untersuchen eine organische Probe, aus der sie Suppe bekommen DNA-Fragmente aller damit verbundenen Lebewesen Probe – Bakterien, Viren und die Person selbst. Dann diese Fragmente müssen in der Reihenfolge zusammengesetzt werden, die wir können identifizieren. Wenn wir eine genomspezifische Kette finden einige Bakterien – das heißt, wir haben dieses Bakterium in der Probe gefunden.
Das Problem ist, wenn wir es noch nicht wissen Sequenzen eines uns unbekannten Virus – das können wir nicht mit dieser Technik erkennen. Aber in der Tat der Autor des neuen crAssphage research Bas Datil berichtet, dass sie fast unbekannt sind 75 Prozent der DNA-Sequenzen in den untersuchten Proben.
Das Datila-Team konnte mithilfe eines völlig anderen Virus einen neuen Virus finden Ansatz basierend auf einer einfachen Idee: Fragmente, die immer wieder werden mit hoher Wahrscheinlichkeit in derselben Stichprobe gefunden sind Teile eines einzelnen Genoms. Sie benutzten die Technik so Cross-Assembly genannt, um eine solche Gruppe zu identifizieren Wiederholungssequenzen in Proben von 12 Personen. Dann bauten sie diese Sequenzen zu einem einzigen Genom zusammen.
Und genau das haben sie: das nach ihm benannte crAssphage-Virus Cross-Assembly-Technik, die zu seiner führte Entdeckung. Sie fanden heraus, dass crAssphage in Bacteroides lebt – eine häufige Gruppe von Bakterien, die in unserem Darm leben.
Als Ergebnis von Untersuchungen fand das Team in 75% crAssphage Darmsequenzen von Menschen in den USA, Europa und Südkorea. Wir sind bis wir wissen, was genau diese Phagen in unserem Darm tun, aber sie spielen definitiv eine Rolle in unserem Darmmikrobiellen Ökosystem.
Und schließlich eine interessante Tatsache: Wissenschaftler haben das in unserem berechnet Der Körper besteht aus etwa 100-mal mehr Viruspartikeln als tatsächlich menschliche Zellen. Wir haben also noch viel zu tun. Finde heraus, was wir wirklich sind.
DNA-Viren
